持中国护照，日本“人文知识·国际业务”签证（

去中国使馆办入境港许可
去香港的时候中间回一趟深圳
以上两条二选一

你必须去中国领事馆办个香港入境签注，2年有效，无限制，每次可滞留14天。

从香港去深圳一下，再从香港离开就没事。

不能，必须在香港过境，才可以的。你这种情况不叫过境。

香港过境建议看看http://www.usihai.com/question/848509.html
香港转机建议看看http://www.hongkongairport.com/gb/passenger/transfer-transit/all/transit_procedures.html

去深圳走一圈

我从这家办的签证 速度快，资料少。
无可挑剔。

签证类型：个人旅游
入境次数：单次/多次
停留时长：15天（具体以实际下发为准）
有效期：三个月/三年多次/五年多次
寄送快递需发送单号给客服，快递收到后审核资料1-2工作日
办理时长：送签后6-8工作日
是否面试：否
递签城市（领区）：北京，上海，广州
北京领区：北京、天津、陕西、山西、甘肃、河南、河北、湖北、湖南、青海、新疆、宁夏、西藏、内蒙古
广州领区：广东、海南、广西
全国领区：全国受理