箱根周游券可以乘坐御殿场奥莱到箱根汤本的巴

可以。
箱根行程要整体来安排，尽量少走回头路。
御殿场根据官方说明有卖箱根周游券的地方，但是真没注意到。

可以

要养成查阅官网的好习惯

http://www.odakyu.jp/sc/deels/freepass/hakone/
http://www.hakone-tozanbus.co.jp/chinese_c/index.html
http://www.hakone-tozanbus.co.jp/chinese_c/pdf/intro.pdf