能直接坐船去香港机场用入台证和护照从香港飞

我没走过中山港，但是看网站上写的跟蛇口港应该类似。直接在登船前就check in了，行李应该也可以直接托运，船是直接到机场禁区里面，不需要入境香港。买票的时候就会需要你出示有效证件和机票，只要能卖票给你海关就不会卡你。注意提前预留多一点时间到达码头，托运行李会要求提前一段时间，过海关也需要一段时间，稍微晚一点就有可能拒绝你登船了……

有国外居留的话这边放行会认为你经香港去国外 所以搭船去香港没问题 香港出发的时候海关看入台证和护照就会放行了

应该是ok的。其实不管有没国外居留，我试过从大陆凭入台证+台湾通行证+机票进入香港然后飞台湾

香港过境建议看看http://www.usihai.com/question/848509.html
香港转机建议看看http://www.hongkongairport.com/gb/passenger/transfer-transit/all/transit_procedures.html
http://www.hongkongairport.com/gb/transport/transport-connection-with-mainland-china/ferry-transfer/passengers-transiting-from-prd-ports.html
http://www.cksp.com.hk/skypier/timetable/main.html
http://www.hongkongairport.com/gb/transport/transport-connection-with-mainland-china/check-in-at-prd/ferryports.html

请问你最后这个方法去成了吗？
现在我的情况和你一样，坐船的大陆海关需要查看证件吗？

可以，但是需要用港澳通行证去香港，护照加入台证内地边检不会放行。