東京地鐵運營商是不是只有JR, Tokyo Metro, Toei Sub

jr不是地铁，地铁就是那两家。但如果指的是轨道，还有n多家。ps.如果你是在考虑三家联合的那个一日券的话就放弃吧，基本都是亏。

地铁就是都营和metro，JR不算。另外还有大大小小各种私铁，例如西武，东京单轨，临海线等等。东京地铁的票券就Tokyo subway ticket有可能划算，其余的都不划算。

地下铁的话就是 东京地下铁 和 东京都交通局
如果说轨道业者的话，23区内大约有十几家

http://www.kotsu.metro.tokyo.jp/
http://www.keikyu.co.jp/index.html
http://www.odakyu-sc.jp/sc/
http://www.fujikyu.co.jp/

如果你值的是轨道交通，那远远不止