JRPASS可以用来往返大阪到京都、往返大阪到奈良

乘坐JR就可以，不能乘坐近铁
从大阪去奈良有JR和近铁两种火车：
【JR】
JR大阪站有直达JR奈良站的JR大和路快速列车，时间不到一小时，票价40-50元RMB
【近铁】
在大阪地铁梅田站坐大阪市営御堂筋線到なんば（难波）
然后转大阪难波站的近鉄奈良線快速急行到近鉄奈良站，40分钟左右，票价40-50元RMB，时间表可参考http://www.juzigo.com/traffic/132059-132025.html

1. 可以。
2. 一般是山手线或者中央线。
3. 请注意，除非你要往返东京大阪，否则买JR Pass是不划算的。因为你提出的路线都很便宜，关西机场到大阪市区是1100日元多，大阪到京都单程560日元，大阪到奈良单程560日元。在东京的山手线单程一般小于200日元。

1、你所说的线路都可以。
2、不过如果购买JR PASS 7日券，需要往返关西-关东一次才划算。

可以，jr的车都行。东京市内最常用的是山手线和中央线。

可以！不过如果光是关西jr pass并不划算。