诚心请教关于通行证和护照的问题，从泰国飞回

我们的计划是从福州先飞香港，在香港停留两天，然后再飞清迈，最后一天从清迈飞回香港再到福州，但是回来买的不是连程机票，所以到香港之后必须出关取行李之后再重新安检进机场，请问这样我还需要用到港澳通行证吗，还是直接用护照就可以，如果需要通行证是不是需要签两次？
麻烦大家帮我看看，谢谢了！！！