东南亚出入境问题，求解！

各位前辈好，我在只申请了马来西亚签证的情况下，在马来西亚游玩十多天后再从吉隆坡坐飞机去印尼，准备到印尼再申请落地签。请问马来西亚海关、移民等出入境管理部门会不会因为没有印尼签证而不让我出境？我坐亚航的飞机，亚航会不会因为我没有印尼签证而不让我上去印尼的飞机呢？
再问，我进入印尼后，游玩数天后，我买机票归国，我分两段分别买票（非联程机票），印尼到吉隆坡，吉隆坡到北京，两段航程在马来西亚境内相隔不超过48小时，因为我的一次马来西亚签证已经在上段所叙述的进入印尼之前用完了，所以我准备在吉隆坡申请过境签，请问我这种情况能申请下来吗（非联程机票情况下）？印尼海关、移民等出入境管理部门会不会因为我没有马来西亚签证而不让我出境？亚航会不会因为我没有马来签证而不让我登机去吉隆坡？
最后一问，如果我从新加坡归国，也是分两段买票（非联程机票），新加坡到吉隆坡，吉隆坡到北京，两段航程在马来西亚境内间隔不超过48小时，同样是没有马来签证，准备申请吉隆坡过境签，那么这种情况下，新加坡海关、移民等出入境管理部门会不会因为我没有马来西亚签证而不让我出境？亚航会不会因为我没有马来签证而不让我登机去吉隆坡？
问题比较多，请大家多包涵