关于新加坡转机去塞舌尔

各位大神：
本人持有新加坡2年多次的有效期之内的签证，想在国内先直飞新加坡，入境新加坡住一晚，第二天再从新加坡飞往塞舌尔。国内飞新加坡订的是酷航，新加坡飞塞舌尔是斯里兰卡航空联程，在科伦坡经停2小时20分，回国是阿联酋航空塞舌尔飞上海，经停迪拜。现在问题来了，请各位大神帮忙解答？
1、咨询了携程（机票在携程订的），他说斯里兰卡航空在新加坡可能只能打出第一段（新加坡-科伦坡）的登机牌，第二段登机牌（科伦坡-马埃岛）可能要到科伦坡才能打出来，具体要看樟宜机场那边。请问我只有第一段登机牌和机票行程单，新加坡海关会不会判断我的目的地是斯里兰卡，因为本人不想办ETA（因为根本不入境）而斯里兰卡对中国不免签，而塞舌尔对中国免签，而我又没有ETA而拒绝我登机从新加坡前往斯里兰卡，有类似经验的朋友请告知一下，谢谢。