第一次踏足日本，做攻略完全迷失，求大神们指

1.不知道为什么，迷糊之下回程就买了东京偏远的茨城机场飞上海的票，听说东京JR站有班车直达茨城机场，请问下午的班次是怎么样的，过去要多久啊？
2.JR我就准备买JR PASS 全国券了，因为想着要横穿大阪、鹿儿岛、京都、富士山和东京，OK吗？
2.还有就是我第一天下午4点多到大阪关西国际机场，想当天直接做JR去鹿儿岛，晚上就住在鹿儿岛上，这样可行吗，会不会太晚呢？
3.D3从鹿儿岛到京都，JR能直达吗？还是要到大阪转？
4.我还在纠结离开京都后，是去富士山还是去箱根，有没有建议，两个做JR都能直接到吗？如果都可以的话，直接哪个更好些呢？
求回复。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。