只有护照和入台证如何进入台湾

我是在澳洲的留学生，想12月底去台湾，我有大通证但是没有签注，签注又要本人亲自去办所以我没法用大通证直接从大陆进入台湾了。我可以在澳洲办理第三类台湾签证，现在有一下几个问题希望大神解答一下啊！！
1.我现在已经有了墨尔本直飞上海的机票，所以我必须要从大陆进台湾
2.我有看说在没有大通证还要从大陆进台湾的情况下可以通过香港走，想问一下具体是怎么个流程？？
如果我使用港澳通行证先飞香港在飞台湾的话，我需要出关在进关吗？
如果我只使用护照可否只是在香港转机而不进关在出关？
3.第三类签证我在澳洲办理但是我通过香港进台湾可以么？？
4.从台湾回大陆可以直飞么？？


问题有点多而且有点乱因为我本人也有点晕。。。
希望大家能回答一下