东京-箱根-京都-奈良-大阪，请问如何乘车？都是

大阪、京都、奈良都在关西，相距都不算远，之间交通方式很多（比如大阪和奈良之间有JR和近铁，大阪和京都之间有新干线，JR、京阪铁路等等）
东京和箱根在关东，之间交通方式也很多（一般可以先坐箱根登山火车到小田原再转新干线到东京站，或者直接从箱根到新宿，视你的目的地而定了）
关西到关东的话则主要是新干线了（新干线山阳本线），当然也可以坐廉价航空了，价格要自己比较一下了
日本交通很发达的，相对的也就比较复杂，还是自己先了解一下吧

http://www.usihai.com/viewthread.php?tid=845167&extra=page%3D2%26amp%3Bfilter%3Ddigest
你可以先去游四海旅游论坛日本版看看帖子
除了上面这个强大的交通帖，你也可以看看关东和关西的游记，里面一般都会有交通方面的讯息

推荐个不一样的，夜行巴士。便宜省时http://www.malidebi.com/53.html

用这个查交通，http://www.hyperdia.com/zh/ 有中文的

只有从关东到关西才需要乘新干线哦。

http://www.hakonenavi.jp/cn/traffic/

http://www.hakonenavi.jp/cn/traffic/