日本自由行交通卡如何选择？

最近看日本交通一头雾水啊，本来想买张西瓜卡走到哪里都方便，不用排队买票了，结果后来又看了看JR PASS，之后完全一头雾水。貌似用JR PASS做新干线最合适的，市区内的交通好像并不是很合适？大家能帮忙看看，有经验的同学能给点建议吗？


我们的行程大致如下：大阪进，直接从机场到京都，京都玩周边共6天主要是京都、奈良、关西，然后回大阪呆两天，再去东京玩6天，从东京回国，在东京主要是市区内，有可能去一趟富士山，但不准备上山。