求教通行证去马来和印尼签证问题

月底启程去马来和印尼，不想在淘宝上办签证，准备在印尼直接落地签，有几个问题很疑惑，请教各位大大。
路线：香港-》吉隆坡-》印尼雅加达-》巴厘岛-》吉隆坡-》香港
证件：通行证（含往来香港一年多次签注），护照（没有印尼签证）
1）我能否持通行证从深圳进香港和出香港，然后在吉隆坡办过境签（这个我以往办过），然后从吉隆坡飞雅加达在印尼办落地签？回程巴厘岛到吉隆坡同样过境并回港。
2）如果我用通行证从香港入境和出境，预计在马来和印尼合计时间超过7天（相当于记录了从香港离开后未回大陆的时间超过了7天），到时候回国内时会不会有什么问题？
3）印尼办落地签要不要看身上现金？落地签多少钱？我不准备换美元，直接带着华夏商旅卡在那边取现。