从日本去台湾，机票用护照买还是台湾通行证买

春节想先去日本再去台湾，从日本到台湾这段的机票应该是用台湾通行证买还是护照买？应该是用护照离开日本吧？入台时直接用入台证入关吧？不会因为护照台湾那边不可用所以拒绝登机吧？