非开放个人台湾游城市，入台证问题？

又是帕劳！我俩朋友打算11月份去帕劳玩，打算乘坐华航经台湾转机去，然后回程的时候在台湾玩几天。
此行程之前有朋友走过，拿台湾通行证+护照+入台证，广州经香港出发，台湾转机，全程无任何问题。
问题是现两朋友所在地是非台湾开放个人游城，要办通行证必须参加旅行社的团才可以。个人旅游无法办理证件。
考虑到办理通行证有难度，所以打算准备 护照+入台证.
在此求教各位大大：
1 持护照可否办理入台证?
2 回程从第三国进入台湾，使用护照+入台证是否可以？
3 回程 台湾直飞大陆,用护照入会不会被查? (突然想到如果持大陆护照香港经台湾出发去欧洲\美洲,来回应该都是可以的)