护照申请表上粘的照片到底有什么用？重要吗?

今天去办护照，说我申请表上的照片面部少块雀斑（可能是夏天晒出来的），与现场照要不同，说出入境有问题，还让写个责任自负声明。
不明白的是，护照上的照片不是现场照的吗？跟申请表上的有什么关系？为什么过境会出问题？有人遇到过吗？
谢谢!