持有美国F1签证，寒假回国申请日本过境签

（看到很多问这个的帖子都是以前的了，不知道现在有没有变动所以提个问。）

lz和男友都是如题美国F1签证学生，12月中旬准备在日本经停8天然后回国，1月上旬再次从日本转机回美国（只是转机而已）。两个人不同的是，lz是大二，人在Richmond, VA。而男友是大四，人在New London, CT.
有如下问题：1、我们分别应该到哪里签？lz去dc大使馆，男友去波士顿或者纽约领事馆吗？2、男友大四，到寒假的时候I-20就只剩下一个学期就过期了，这样会被签证官刁难吗？
3、lz在dc的日本大使馆网站http://www.us.emb-japan.go.jp/english/html/travel_and_visa/visa/transit.html 上面查到了签证材料。不过似乎没有任何预约签证之类的东西。。。所以是带着上述材料直接去吗？据大家经验是否需要额外的材料？例如机票和行程安排/酒店预订信息？
4、大约什么时间办签证合适？（看其他帖子说是计划入境前三个月内）


有其他注意事项请补充。。万分感谢！