持有某国签证的护照去香港转机，起程大陆出境

我的港澳通行证上有香港多次入境签注，而且可以指纹通关，但是此时我只是想去香港转机出国，我可不可以不用护照，而只用港澳通行证直接指纹过关？ 因为关口排队的人实在太多了。。。

不知道我说清楚没有。。。

再详细解释一下，就是我从香港转机来回有四道关口：
1：从大陆出境，此时我可以用港澳通行证直接指纹通关。
2：香港入境，这时港澳通行证的指纹通关无用，必须排长队经工作人员窗口。这时我还是继续用港澳通行证入境？还是可以用护照入境香港？ 如果用港澳通行证的话，进入香港完全没问题，但是又从香港机场去别国的时候，我护照上就没有大陆出境和香港入境的记录了，不知道这样行不行？ 假如我用护照入境香港，但是护照上又没有我大陆出境的记录，他们让我入境吗？
3：从别国回香港然后回大陆，香港出境时也同样可以选择两种方式。
4：大陆入境，港澳通行证加指纹通关。

请教达人！