用马来西亚签注从HK过境去TW，会不会影响第二次

前因：2011年曾使用马来西亚签注经HK去了TW，但实际并未去过马来西来，护照有盖印；现状：1、 近期将从新加坡经吉隆坡去加德满都，中间会在吉隆坡呆一天，可以再申请马来西亚的过境签么？2、 之前申请的马来签注用作其他途径，会不会影响这一次的过境签注？
还要麻烦了解的同学分享一下经验。非常感谢！