日本7日游，东京→京都→大阪，请教怎样安排交

小女子打算4.29-5.5从东京一路到大阪，具体安排是这样的：
4.29 春秋航空到茨城机场，然后到东京
4.30-5.1 东京
5.2 东京-京都
5.3晚 京都-大阪
5.5晚 从关西机场走


有几个问题：
1、因为我是茨城机场着陆，那是不是就没有地铁2日pass可以买了？有其他的pass可以选择吗？
2、买jr的7 day pass有没有必要
3、有没有前辈坐过东京到京都的夜班车，赶脚如何？


拜谢！