想从马来西亚办入台证，持护照入台湾可行么？

问题基本如题，经过问答和论坛，我还是弄清了没有大上海这种户口的屁民还是可以绕第三国，进台湾自由行的，但是我还有以下几个不解之处：

1， 我一般是在吉隆坡转机较多，那我可以在马来西亚办入台证么？如果可以，那需要办理多长时间？

2， 我要从台湾回大陆，光持入台证和护照可以走么？不会在机场被拦了没法入关么？

求高人回答