求解！第三国飞台湾入境停留后，经香港转机飞

我是持中国护照，有第三国签证（澳洲)，已经在澳洲办好入台证，但是没有大陆居民往来台湾通行证(紫本）。
计划买长荣航空澳洲-台湾-香港的联程往返票；然后另外再单买一张香港飞南京的往返票（其他航空公司的）。打算先从澳洲搭长荣航空飞台北，停留12天之后，从台北搭联程的长荣航空去香港，再从香港转机不出关直接飞回南京。
在网上查了一些资料，知道从返程从南京飞香港的时候，要说是去香港转机飞澳洲的。然后出示一张去澳洲的联程票行程单。
如果这些都能做到，是不是基本不会有问题了?


我有一个疑问就是，我在澳洲出境的章是12月19号的，然后中间去台湾不会留下章（听说台湾只会盖在入台证上），去香港只是转机也没有任何出入境记录，但是我到南京已经是1月3号了，这样边检的人会不会询问我中间的这段时间去了哪里？
我可以直说我是去了台湾的吗？因为怕这样会不会对回程从南京出境有什么影响？


求解~