入境次数，申请为几次好呢？

我的目的地是布拉格。先是飞到法兰克福，然后坐欧铁至布拉格，呆上几天之后，从布拉格飞出，在法兰克福转机后回国。看起来只是入境一次，但是是不是能多签几次保险一些？又怕申请次数多了被拒？那就申请两次？