从德国去台湾自由行上海转机问题

各位好，我在德国申请了“第三类”大陆地区人民台湾自由行的入台证，月底出发，订的机票是东航：法兰克福经上海转机到台北。订东航是因为最便宜，别的航空公司最少都要贵个300欧以上。可是刚才在这里爬文的时候发现一个问题就是从国内飞台湾好像不但要有台湾签发的入台证还要有国台办发的赴台证才行，我还是第一次听说这个问题，当然我也没有国台办赴台证，不知道这样我从上海飞台北会不会有问题啊？我个人感觉在上海3个小时转机不用出关应该问题不大，可心里还是不免有些忐忑，如果谁有这方面的经验或了解较详细的，还请赐教，谢谢。